阿妹送了许多好吃的到黑旗军营帐内， 随后黄飞鸿也回了黑旗军，要求加入黑旗军。刘永福率领黑旗军一战，打得非常激烈，就在日本人即将登岛之际，刘永福临危受命让黄飞鸿担任棒头，教黑旗军习武对敌。黄飞鸿不肯答应刘永福，他怕自己再一出拳不知道是对是错，刘永福只好一拳打在自己身上，用黑旗军的性命相要挟，才让黄飞鸿不得不答应。阿妹带黄飞鸿去五花箭神那里游玩，还跟他说了鸢尾花的花语，以及村长女儿和武士的故事。无论是鸢尾花还是故事，都点点滴滴与岑慧慧有些相似，让黄飞鸿脑海里一直闪过岑慧慧的身影，不自觉地就头疼了起来，心里特别痛苦。黄麒英和玉玲珑谈起了黄飞鸿，期盼黄飞鸿早日回家，十三姨听到之后，又忍不住去海边找许愿石，等黄飞鸿回家。牙擦苏为了让十三姨对黄飞鸿死心，特意带十三姨去看他安排的一出戏，让十三姨知道黄飞鸿不仅在外面养着女人，还好赌成性。十三姨看到眼前的一切，一点也不相信黄飞鸿是那样的人，所以生气地跑开了，牙擦苏只好去追十三姨。被牙擦苏安排来演戏的人，看到牙擦苏要离开，马上就追着牙擦苏要钱，结果正好让十三姨看到了这一切，知道牙擦苏骗了她，所以生气地责备了牙擦苏。牙擦苏说明，自己只是想让十三姨看清黄飞鸿的为人，而十三姨却表示她只看到牙擦苏骗了她，而她根本不需要一个骗她的人。牙擦苏当众被十三姨责骂，路人看到了都骂牙擦苏是个骗子，猪肉荣更是奚落牙擦苏不配与黄飞鸿相提并论，因为他才是有资格的那个人。十三姨回到家里，一个人走进了黄飞鸿的房间，回想当日牙擦苏拦阻黄飞鸿出海的情形，她忍不住笑牙擦苏傻。当日，牙擦苏为了十三姨，不想黄飞鸿为了岑慧慧出海，可黄飞鸿却非常的坚持，并谎称自己并不是想去找岑慧慧，而是去打日本人。黄飞鸿临走前，让牙擦苏照顾十三姨，并教牙擦苏用计让十三姨恨他，牙擦苏于是想到了这出骗人的戏。1895年5月，日本海军对台湾岛大规模炮轰，五花部落的神树也被炸了一个大洞，根部尽毁导致整棵树枯萎。黑旗军想要封路不让五花部落的人知道神树的事情，可黄飞鸿却把阿妹带上了山，让她知道神树已毁的事情。黑旗军不知道神树对五花部落的重要性，以为树没了并没有什么，阿妹于是把神树的故事告诉黑旗军，最后她便在神树面前祭拜之后，回族里接受惩罚。神树被毁，村长要将阿妹处死，黄飞鸿只能带人来救阿妹，可村长执意要处死阿妹，黄飞鸿只好许诺替阿妹去死。黄飞鸿的话一出口，阿妹马上当众表示，她爱黄飞鸿并愿意为黄飞鸿而死，五花部落的人马上起哄了起来，让他们接受五花神箭的考验。黄飞鸿答应接受五花箭神的考验，阿妹于是要求自己向黄飞鸿射箭，然后趁大家不注意把麻醉药粉涂在箭头上。阿妹的五箭没有射中黄飞鸿的要害，又有麻药帮黄飞鸿止痛，让黄飞鸿平安度过了这一关，没有因为身中五箭而倒下。翠鸟去检验黄飞鸿的伤势，明知道阿妹和黄飞鸿的计，却还是装作不知情的样子，宣称黄飞鸿是第一个中五箭而不死的人，让五花部落的所有人都不再惩罚阿妹和黄飞鸿，帮阿妹平安度过这一劫。十三姨突然想到日本人服毒自尽的事情，是把毒药藏在了牙齿内，于是深夜去找牙擦苏，打算一早去衙门把日本间谍牙齿里的毒药去掉，再对他们严刑逼供。十三姨和牙擦苏走到衙门口之时，百姓们都义愤填膺地要杀了日本奸细，十三姨只好让牙擦苏顶着，自己先去看那些奸细，可没想到奸细已经全部被人给杀了。樱花夫人因为奸细任务完成，去衙门把所有被抓的奸细杀死，然后一个人回了周氏医馆，换回自己的原装真身柳华生，准备继续潜伏下去，看着大清亡国。黑旗军虽然死守炮台不让日本军舰进入台湾，可大清却向日本服输签定了马关条约，让黑旗军上下都非常气愤，刘永福于是率领愿意陪他留下死守台湾的黑旗军，继续留下来保卫台湾。六月，日本军队抢滩台湾岛，刘永福带黑旗军孤军奋战，本来节节胜利，最终却因为军火不足，导致他们伤亡惨重，但刘永福还是带着黑旗军将士，要血战到底宁死不屈。
